Электрон в атоме не имеет какого-то определённого положения. Только при своём взаимодействии с внешней средой он с той или иной вероятностью проявляется в некоторой окрестности ядра атома. Область, в которой вероятность обнаружения электрона максимальна, называется электронной оболочкой. На новых изображениях видны различия между атомами разных энергетических состояний.

При помощи сканирующих туннельных микроскопов отдельные атомы можно не только увидеть, но и переместить в нужное место.